又过了半个太阳纪后，“天”上众神用惊人的智慧发明并制造出庞大的、并用以横渡星空的战舰，黄昏战神命令众亚神乘坐战舰将临并收复盘古大陆，而祝融族的首领修斯也在此列，不过修斯并未忘记祝融族作为盘古大陆文明内应的使命。
所以在降临盘古大陆之后，修斯把天上众神的智慧，也就是科技，带给了盘古大陆上的生灵。
起初，盘古大陆的文明抵御不住亚神们带来的战舰，以至于节节败退，血流成河，生灵涂炭，不过在得到修斯赠与的科技火种后，各大文明纷纷迅速崛起，发明并制造出各种各样的战争机器来抵御亚神的入侵。
而修斯这位尊贵的亚神向卑贱的凡人们传授神的智慧，也就是科技一事，最终还是被其他的亚神发现了，于是愤怒的亚神将修斯这位“窃火者”杀死，并讲他的神躯绑在了通天塔残骸的顶端之上，以警示盘古大陆上所有的生灵。
不过盘古大陆上的生灵并未因为修斯的死而向入侵的亚神们示弱，修斯的死反而彻底激怒了盘古大陆上的生灵，十一片大陆上的文明再次聚首联合起来组成了新盘古世界的联合军抗击来自“天”上的亚神大军。
并在历经了长达三千年的抵抗战争后，联合军终于击败了来自“天”上的亚神大军，亚神们乘坐巨大的战舰狼狈地逃回到“天”上后，联合军为了纪念战争的胜利，也为了纪念从神那里给他们带来科技火种的“窃火者”修斯，在通天塔遗迹的顶端修建了修斯的神像，并把修斯追封为新盘古世界生灵们带来文明之光的火神。
在击退亚神们的战舰后，新盘古世界得到了短暂的和平与安宁，但并未持续太久，因为“天”出现了新的问题，在失去盘古大陆灵气的滋润后，众神们的神力开始随着岁月流逝，本来拥有永恒寿命的神也纷纷开始陨落。
在死亡恐惧的威胁下，“天”上的众神重新燃起了夺回盘古大陆以重塑神力与无尽寿命的斗志，因此“天”上众神的第二次入侵很快就到来了，这次从“天”上将领的，入侵新盘古世界的巨型战舰也变得更多了。
但吸取了上次战争失败的教训，众神们采取了与上一次入侵截然不同的策略，竭尽全力干扰新盘古世界的文明联合起来，并渗透进内部瓦解他们的联盟，而后再逐个击破。
起初，众神们各个击破的战略奏效了，新盘古大陆各大文明都陷入了内斗的战火中，而“天”上的众神作为战争商贩给各大文明提供武器，不过各大文明很快就察觉到这实际上是“天”上众神们的阴谋，于是瞒着众神的眼睛，在私底下建立了联盟，并采取了将计就计的应对策略。
各大文明之间的战火虽然延绵不断，但实际上都没有伤及到根基，他们都在暗中保存实力，一方面不断地获取从“天”上众神那里得来的科技，另一方面伺机而动，等待“天”上众神露出狐狸尾巴，而后再联合起来给其致命一击。
果然，在各大文明过家家式的战争游戏下，“天”上众神以为打得差不多了，自以为抓住了时机，一举发动带来的舰队加入了战争中，不过众神们很快便被贩卖给各大文明的武器打得节节败退。
这一战中，“天”上的众神损失惨重，原先入侵的十六艘战舰被击落了十二艘，有三艘被俘获，剩下的那一艘极其狼狈地逃回了“天”上，此外，陨落的神与亚神也不计可数。
以至于到了最后，神王黄昏战神亲自将临新盘古世界出手，不过在失去灵气滋润后，黄昏战神的神力流失得也十分厉害，最后竟然敌不过新盘古世界十二个最强文明的领袖联手。
这十二个击败黄昏战神的文明领袖，又被后世之人称作十二祖巫，十二祖巫虽然击败了黄昏战神，不过并未彻底将其弑杀掉，黄昏战神在逃走时，使出了神通将盘古大陆大部分的灵气都剥落了下来，并带回到“天”上。
重获灵气的“天”重新燃起了生机，而众神们也渐渐恢复了神力以及永恒的寿命，不过失去了大部分灵气的新盘古世界却面临末日，灵气是盘古大陆上生灵们繁衍生息赖以生存的东西，所以失去灵气对于大部分种族来说都是毁灭性的打击。
所以为了争夺盘古大陆上剩余的灵气延续自身所在的部族，十二祖巫纷纷带领自己的部族爆发战争，此次内战中所有组建起来的联盟乃至是文明都被彻底解构，每个种族都极其自私地为了得到灵气而残忍地将其他种族屠戮掉。
来自魔界的女魔伊娃不忍心看着盘古大陆上各大种族相互屠戮争战，所以用两仪生灭阵将亡灵的怨气转化成了灵气，并用周天星斗大阵使得灵气均匀地在整个盘古大陆上流动，在灵气稀缺的问题得到根源性的解决后，盘古大陆上各个部族也渐渐地停止了战争。
但是那一战中还是使得许多弱小的种族蒙受到灭族之灾，让盘古大陆上的生灵放下厮杀屠刀的女魔伊娃也摇身一变成为了生灵们侍奉的神明，盘古大陆上的生灵把伊娃称呼为女娲，而后世之人又把伊娃补充盘古世界灵气的世界成为女娲补天。
伊娃除了补天之外，还做了另一件大事，那便是揉合了盘古大陆上各个种族的血脉创造人类，而人类又把自身以外的生灵，也就是盘古大陆上原先的各个