2月17日，俄日同时向对方宣战，日俄战争同时打响，而同一时间，日本大使与俄国大使同时希望中国成为其盟友国家，向对方发起进攻。但与日本相比，俄国人的口气就明显傲娇了许多，他们依旧认为直接不可战胜，日本人绝对没有消灭他们的能力。而日本则依旧提出中日密约内容，要求中国务必遵守双方约定，对俄国作战。
2月18日，东乡平八郞派遣日本海军参谋处少佐有马良橘与广濑武夫率领78人组成的堵塞船队，驶向了旅顺港，他们的目的是将堵塞船队自沉与旅顺口，从而将俄军太平洋舰队旅顺舰队堵在旅顺口。
新任司令官马卡洛夫并不是斯托尔克这样的蠢材，他曾经担任俄军最精锐的波罗的海舰队司令，对于战争有着惊人的敏感性。他要求士兵二十四小时警戒，在堵塞船队五艘战舰抵达旅顺港口之前便被俄军发现，五艘舰船全部被击沉，仅有29名日本水兵乘坐气垫船逃走。
3天之后，日本水兵被中国渔民发现，29名日本水兵已经因为脱水与饥饿而陷入昏迷，渔民们将他们送到了东北军区，经由东北军区负责人又将这29名日本水兵送了回去。
由于日军是夜间袭击，再加上五艘拖船在距离旅顺口五公里外被击沉，俄国人仅仅认为他们是登陆舰队，并未意识到日本人的真正目的是想要堵塞旅顺口，继而将太平洋舰队堵在旅顺口内。俄军上下大声嘲笑日本人的鲁莽和无知，居然用几艘穿就登陆旅顺，要知道旅顺有五万正规俄国陆军，一万海军陆战队水兵，一万增援部队，日军不派遣十万以上围攻旅顺，是根本不可能完成任务的。
斯托尔克在临走之前扬言：“小小日本的偷袭，只能说明他们恐惧和害怕，诸位，如果他们有信心，就不会采用偷袭战术了。”斯托尔克的手下军官纷纷赞扬起来，说亚洲人永远战胜不了白人，不管他们用什么方法。
但是马卡洛夫却意识到了旅顺的防御不单单是因为斯托尔克的愚蠢，许多舰长以及指挥官都非常昏庸，而促使他们晋升占据要职的原因，是因为他们都是皇亲国戚，也就是俄国远东总督阿列克谢耶夫的亲信。马卡洛夫的行为尽管从公理上还说无可厚非，然而阿列克谢耶夫之所以能够在远东自己当土皇帝，其原因就是这些公爵男爵等贵族军官的支持，于是双方争执起来。
在接替了斯托尔克出任太平洋舰队司令之后，马卡洛夫立即召集所有人开会，尽管斯捷赛尔是旅顺海陆防御司令，然而马卡洛夫的军衔最高，且此处于是海军管辖范围之内，且马卡洛夫在国际上赫赫有名，所以马卡洛夫将军顺理成章地成为旅顺的实际指挥官。
辽东陆海军防御司令斯捷赛尔，旅顺地面防御司令康德拉琴科、旅顺炮台防御司令斯米塞克，南山守备司令特列克亚杰夫、第4师师长福克、第5师师长阿什利多维奇、新西伯利亚第2步兵师师长亚历山德罗维奇等人参加了旅大防御计划会议重新部署防御。
马卡洛夫积极布置防御，并再三强调不能轻视日本人，另外他认为日本并不知道他们的实际损失，如果俄军只是消极的防御，不但会让敌人士气上升，让敌人知道自己实际兵力，还会让自己的防御变得更加被动，从而导致整个防御的失败。与此同时，马卡洛夫还下令太平洋舰队海参崴分舰队立即出发，在日本海向所有日本船只发起挑战，迫使日本海军联合舰队分兵，减轻旅顺的压力。