谈判结束，双方在各国领事见证下签署停战协议，日本为颜面考虑，强烈要求李伯阳额外签署保密协议，威胁不准将协议内容外露。（..)
李伯阳权衡了轻重，还是答应签署这份保密协议，自己得了里子，面子让日本人得去也无妨，将这份谈判协议透露出去，势必引得各路军阀忌惮，得不偿失。
协议签署当晚，李伯阳亲给前线去电，命令罗群在包围圈西侧打开一个缺口，放日本人撤退。罗群正组织部队训练，只能遗憾的遵从命令，从西边放开一条小路，只允许日军携带撤离，而轻重机、山炮、电台则通通缴获。日军谈判失利，面对数倍于己虎视眈眈的皖南军，只能饮恨丢下武器，狼狈撤离。
第二天一早，江防司令董世武亲率手下将水雷撤去，紧接着日军舰在英军舰的监督下退往九江。
一场大战消弭，日本人抢先登报，称大日本帝**队已经惩戒了皖南，皖南已于昨日签署赔偿书，云云。
这种语焉不详的报道看在国人眼里，还以为真是日本人用武力逼迫皖南赔款，一时国人大哗，北京、上海、武汉的学生冲上街头****，抗议北京执政府对外无能，要求捍卫国家主权，同时全国各大报纸披露芜湖被日舰轰击两日的惨状，称赞李伯阳为不畏日本帝国主义的爱国将领。
李伯阳闻之这个称呼后颇为惭愧，这次与日本的冲突爱国心有之，可到后来更多的却是为地盘私心考虑，如今国人盛赞自己为爱国将领，着实受之有愧。
就在协议签署第三天，上海花旗银行代替皖南向中日实业公司偿还日元五百万整，这个消息一出，原本与李伯阳保持距离的芜湖工商界立马转了风向，不仅商会上赶着无偿为镇守使公署捐献重建芜湖金，而且金融界也开明起来，愿意大额借款给李伯阳，不论用途。
李伯阳内心瞧不起这些逐利的商贾，不过他不会和白花花的银元过不去，再与商会推脱几日后，做出一副勉为其难的样子收下这钱重建金，又从交通银行借出五十万块银元，作为华为矿业公司启动款。
重建工作有条不絮进行，经过日舰的一通轰击之后，李伯阳借机对长街做出新的规划，原先的码头继续沿用，可主要街道却推翻重建，原本狭窄的道路扩宽至四向车道，而沿岸的建筑也摒弃了低矮的土木楼，随之而起的是大上海普遍的钢筋混凝土高楼，尤其是地控要害的地点，李伯阳专门请到德国的工程师，以战时堡垒要求建造，同时在长江河道最狭窄险要处修建炮台基建，为以后落实炮台防御打下基础。
重建工作涉及各方各业，李伯阳几乎把手头上所有的财力物力都投入到里面，而此时建设银行顺势而起，以贷款存款发放工程为条件，吸引了大批商人前来，经过一段时日的经营，总算是把前些日子与日军交战时筹借的军费平了出去。
就在皖南局势稳定之际，东南局势发生了微的变化。
九月初，考察欧美各国政治专使徐树铮从英国向段祺瑞发来一份电报，说奉张已于日本签订秘密合同，以东南沿海渔业权威抵押，借款数百万巨以购置新式武器，目的是准备在来年开春发动武力统一东南各省的战争，此消息不胫而走，传到孙传芳耳中，使得他大为惊忧，坐卧不安。
与此同时，从保定军校离职来浙的蒋百里也给孙传芳带来一个消息，说杨宇霆、姜登选已经在编练军队，只等所订军衔到手后即取浙、闽两省，其大概时间约在明年的三月施行。
此消息一出，孙传芳再也坐不住，既然与奉军开战势不可免，与其坐等奉军准备充分后前来进攻，不如趁其立足未稳，军力分散，先下手为强，发动倒奉。
孙传芳先给南京陈调元发去密电，告知奉军机密，9月17日，陈调元借姨太太岁庚摆宴，邀白宝山等苏军将领会面召开会议，决定一致抗拒奉军，并以防浙为名，将军队向宜兴移动。
此举果然瞒过杨宇霆，他喜见陈调元与浙军对峙，称赞之余拨出大批军费弹药，作为奖赏。
9月20日，孙传芳使者来芜湖，邀请李伯阳派使者前往杭州商定倒奉军事会议，李伯阳为显诚意，派许正邦为使者，前往杭州。
10月7日，东南各省代表齐聚杭州，讨论倒奉战争事宜，在会议上，各省代表早就得到孙传芳暗示，齐称奉军势大，凭一省武力抗奉，各自为战又易被奉军击破，决议成立五省联军统一指挥，并一致推举孙传芳为五省联军总司令，周萌人为副司令。
孙传芳以自己资质尚浅推迟，经过五省代表的劝进，他方才就任五省联军总司令，并以联军总司令身份任命福建督办周萌人为闽军总司令、江苏帮办陈调元为苏军总司令、原安徽督理、曾被李伯阳生父徐普赶下太的马联甲为皖军总司令、江西督办方本仁为赣军总司令、孙传芳本人兼任浙军总司令，并树下“拥段反奉”的旗帜，拥段是因为段祺瑞声望足以影响全国，反奉则是惟张作霖一人是讨，把目标锁定一人，便于减小战争阻力。
会后，孙传芳严令各省代表封锁消息，同时以陈调元部往宜兴防浙为由，令各部向太湖集结。
电报传回芜湖，李伯阳得知孙传芳将发动战争的时间定在后日双十节这天后大为惊叹，深感孙传芳用兵之神速机敏，联军刚成立就敢全面出击，就怕奉军即便是获知了五省倒奉，都想不到攻势会来的这么快