现在魏忠贤得意之下，给朱由检送上一份他自己都没有想到的大礼允许朱由检自行挑选四武营的军官。有了魏忠贤的“口谕”，朱由检当然不能浪费。
从山东回来的奋武营的士兵们，正在度过愉快的假期，而朱由检，却在忙着四武营的整顿。
四武营现在每营有九千六百士兵，加上各级军官，总数已经过万。朱由检依据奋武营的设计，将这九千六百士兵，分成一个骑兵卫和两个步兵卫，每卫有三千二百士兵。
奋武营已经有了一个骑兵卫和一个步兵卫，指挥使分别是刘玉栓和李红军，现在增加一个步兵卫，指挥使是蒋正才。
耀武营、练武营和显武营整顿的幅度比较大，除了杨都因为比较厚道，继续担任练武营指挥使之外，耀武营和显武营的指挥使都被朱由检撤换了，有祖大寿担任耀武营指挥使、袁崇焕担任显武营指挥使。每营都辖一个骑兵卫和两个步兵卫。
满桂原来是宁远总兵，又是蒙古人的后裔，擅长骑射，朱由检就让他挂四武营指挥佥事衔，负值四武营四个骑兵卫的训练，由于朱由检常常不在四武营常驻，满桂是实际上的四武营最高指挥官。
四武营的训练，包括思想训练和身体技能训练。思想训练是内容有三项，主要是借用了老人家的军事思想：
一、军人以服从为天职。作为士兵，必须服从军官的管理，严格执行上级的军令，哪怕是作为诱饵，有去无回，也要不折不扣地执行。一支纪律严明的军队，在战场上才有战斗力。
二、军人的精神是勇上前线、敢打头阵、不怕牺牲。对于国内外一切敌人，军人都要有打败他们的信心和勇气，不能被建奴、蒙古这些纸老虎吓到。
三、军人的使命是保家卫国、守土开疆。养兵千日、用兵一时，军人是由国家提供军饷，战争史必须为国家浴血奋战。战后由国家lùn_gōng行赏，死亡士兵的家人获得抚恤，受伤的士兵得到补偿和生活保障。
至于士兵的身体技能训练，朱由检以奋武营的训练位基础，整理出《士兵训练手册》和《士兵训练大纲》，准备在军校中培训军官，现在可以直接拿到四武营中训练。
朱由检召开四武营第一次高级军官会议，在耀武营举行，参加会议的有四武营指挥同知朱由检、四武营指挥佥事满桂、耀武营指挥使祖大寿、练武营指挥使杨都、显武营指挥使袁崇焕以及各营的卫指挥使，奋武营的刘玉栓、李红军都在山东未回，只有新任的步兵卫指挥使蒋正才参加了会议。
“殿下，末将看过《士兵训练手册》和《士兵训练大纲》，如果士兵都达到大纲上的标准，战斗力不会弱于辽东军。但末将不明白，为什么要浪费时间从事队列训练，难道只是为了阅兵的需要？”袁崇焕微皱着眉头，他从骨子里看不起京师军，这些士兵基本没有上过战场，也没有什么上战场的机会，顶多就是让兵部阅个兵、吓唬吓唬那些怕事的百姓，真要见真章，就要放到辽东战场。