里美有一个11年前在学校失踪的姐姐，而11年后她也进了从前姐姐念的同一所中学就读，不料就在开学典礼当天，里美与好友香苗以及同学悦子就在学校的一座古老废弃校舍中听到一声声呼唤里美的声音，至此，校园中接二连三的发生恐怖又怪异的事件，里美与好友香苗以及同学悦子也被卷入一场花子之谜....
里美的姐姐为何失踪？花子的真面目又是谁？那个常出现於镜中以及暗夜校舍中的恐怖身影到底是什？为了解开这些谜团，大家决定请出钱仙来询问，然而就在这时，更恐怖的事情发生了........
你听过「鬼娃娃花子」的传说吗？传说花子是为了到学校找妈妈，
却被坏人杀死在厕所里，但花子并不知道自己死了，还是一直在校园的厕所中寻找妈妈....
本拓上的本町小学附近有另一所小学，不知为何接连发生了小学生的连续杀人事件，消息传到本町小学，学生之间议论纷纷。
拓也的妹妹夏美的班上同学，问钱仙凶手是谁，钱仙的回答是「花?子」。小朋友们直觉想到「鬼娃娃花子」。「鬼娃娃的花子」是一个传说住在厕所的幽灵，而根据钱仙的预言，下一个受害者正是夏美，并且「花子」明天就会现身……。
夏美立刻跑去拓也的班上，找拓也求助，没想到拓也不当一回事，把夏美赶回去。夏美只好和同学浩志一起回家，途中到一位非常漂亮的女孩，向他们问到本町小学的路。
这名美少女叫作水野芽子。第二天刚好转学进入拓也的班上，成绩优秀的芽子，不久在班上即大受欢迎，有一次，芽子被班上的加奈子与小绿撞见从谣传的「花子」出现的厕所出来，从此竟被同学们怀疑是「花子」，只有拓也一直护著她。
在这之后，有一天，拓也与芽子一起打扫饲养著山羊的小屋。在拓也为了拿学级日志到离开到职员办公室时，加奈子和小绿正好在走廊。突然她们看到眼前出现一大片血迹，吓得拔腿就跑，没想到混身是血，拿著镰刀的芽子，就站在前面……。这个就是厕所中的花子。话说还听吗？”，若星问着他们。
“若星啊，你就说完吧！”黑子说道。
“好吧。”若星将自己知道的都说了出来。黑子他们都在安静的听着，突然楼下传来了关门声，大家都知道剧情要开始了。
第一个是十三阶梯。
“一”
“二”
“三”
“四”
“五”
“六”
“七”
“八”
“九”
“十”
“十一”
“十二”
“咦，没有十三层啊。”一个小男孩的声音响起来。
晋臣他们跑过去，看到了四个小孩，两个女孩，一个男孩看起来很魁梧，一个看起来很弱小，两个女生，一个长的很漂亮，一个很普通。