1859年，洪秀全重新回归酒池肉林的生活，贪图享乐，不愿再管天国的政事，将刚到天京40多天的洪仁玕封为干王，打破“永不封王”的诺言，引起众将不服。在洪仁玕建议下，洪秀全将当时地位最高、战功最著的陈玉成封为英王，并下达了“外事不决问英王，内事不决问干王，二事不决问天王”的诏旨，洪仁玕就飘飘然了。
洪仁玕死要面子，他的《资政新篇》得到很高评价，如能实现，天国也许能就此改造成一个近代化国家。可惜这本书虽然被洪秀全拿去亲笔批注，允许推广，但除了增加几个新潮西式官衔，几乎没有任何政策落实。因为他虽然能提出各种精辟的见解，却缺乏坚持和推动的勇气。比如他曾认为洪秀全的上帝教有很多不合理之处，还写了一本《天妈天嫂辩正》，试图纠正洪秀全的“错误观点”，结果在洪秀全的斥责下立即一百八十度转弯，转而成为上帝教的鼓吹者；他在香港期间坚决反对一夫多妻，但到了天京却已妻妾成群，而且振振有词地引用洪秀全梦中所得到的“上帝新旨意”为自己辩护。他主张依法治国，主张精兵简政，主张严格控制官员提升，可他却动辄保举几十人一次性升官，六爵、丞相，已经多到数不清的地步。
洪仁玕原本希望通过改革和思想建设，使得全民思想解放，最终他成为洪秀全最忠实的吹鼓手。凡是他原先主张、洪秀全也不反对的，就可以坚持到底；凡是他原先主张，而洪秀全不以为然的，最终一定会照着洪秀全的意思办，他没有改变洪秀全，却被洪秀全彻底改变了。原本强烈的革新冲动，也畸变为把秀才改为“莠士”、把举人改为“约士”之类的文字游戏癖了
洪仁玕在朝中没有什么盟友，却有一大堆的政敌。洪仁玕和李秀成的关系一直就不睦，以至于叛将李昭受写信给李秀成，挑拨他投降清廷。他对外说，李秀成打破江南大营的“围魏救赵”，是他的计策。这让李秀成十分鄙视他，因为“围魏救赵”计策制订之初，洪仁玕并不知情。
洪仁玕小肚鸡肠，容不下有才学的人，还十分讨厌章王林绍璋，说林绍璋一无是处。实际上林绍璋为人敏捷克勤，苦心向外国人学习西洋近代科学，熟悉地理和机械学，是太平天国领导人物中学识渊博、才艺见长的人。
洪仁玕对于诸王割据是反感的，他抵制的办法，是把兵权、财权收归洪姓子侄、驸马，许多还都是小孩子，他把诸王手下部将调离、封王，大家都是王，那听谁的？只好各自为政了！结果造成整个太平天国军政体系的紊乱、人心涣散。
而这时候的曾国藩，确是两江总督，掌握江苏、江西和安徽三省大权，他还兼任钦差大臣，长江南北两岸所有文武官员都归他节制，所以安庆大战一开始，分裂的太平天国就处于劣势。
更让陈玉成绝望的是，因为他的阻拦没有过江投奔李秀成的韦俊，却率部八千人投降了曾国藩！