在嘉历四年九月某日，神田明神神社附近突然有土堆隆起，接著天降巨雷击中土堆。在雷光中，附近的住户都很清楚的看到有一个身披古老大铠的武者身影。
吓坏了的百姓等雷震过了之後出外察看发现那个土堆有裂缝，进去探察之後才知道这土堆是座古坟。
不过奇怪的是坟内并无棺柩或是其他的葬物，所以也无从知道这到底是不是将门的确实之墓。
而後直至江户开府，都陆续有听闻到将门怨灵作祟的事情，直到幕府将新的神田明神神社修筑完成後，才没有再听过类似的怪异事件。
新的神田明神神社修筑好之後，在三代家光时代以幕府官方的名义举行了盛大的迁灵祭祀，把将门之灵从现在的将门首冢那里迁了出来到新的神田明神社。
首冢则刚好在三上藩上屋敷之内，因此三上藩就代代持续祭祀首冢。也因此，将门所化身的神田明神之信仰，慢慢的从江户流布而出，成为江户时代关东平民百姓所热烈信奉的神祇之一。
宽文三年，後水尾天皇接受幕府方面的建议，也下旨赦免了平将门的谋反之罪。
时间流转，在到了幕府灭亡明治政府成立而迁都江户改为东京时，在明治七年的时候明治天皇亲赴神田明神神社献祭得以正式受到皇室的认可与尊崇。
明治初期新的都市计划将三上藩的屋敷列为大藏省的官厅预定地，所以旧的三上藩屋敷全数铲除改建成了新官舍，而将门的首冢只保留了以坟冢为中心及周围一点点的地。
直到在大正十二年时突然发生了关东大地震，东京市焚毁过半大藏省官厅也整个烧毁，而将门首冢也整个崩裂开来。
在重建新的大藏省官厅时就把将门首冢也埋了起来，上面建起了新的官舍建筑。
没想到昭和一年重建好大藏省官厅时，就发生了许多的怪事。首先是刚迁入官厅办公的大藏大臣早速整尔没几天突发疾病而死，接著好几个课长级的官员也突然病死。就在众人都怀疑的时候政务次官武内作平与其他的几个大藏省次级官僚也在官厅内的官舍中碰上了不知名的怪异骚动而吓到落荒而逃。所以将门作祟的传言不迳而走，搞到整个东京市的住民都惶恐不安。
据说当时的若槻礼一郎内阁已经因为大地震後的金融恐慌被打到满头包，最後下台换成了田中义一内阁。当时东京市民间谣传若槻之所以下台也是因为将门的怨灵作祟，而且这些有关怨灵作祟的谣言越传越广，连京都大阪方面的关西地区也都有所听闻，所以田中上台後即在昭和三年时让大藏大臣三士忠造委托神田明神神社神主平田盛胤在将门首冢处进行慰灵祭。
当时全体大藏省课级以上包括大藏大臣以及首相田中等的内阁官僚全数参加祭礼。祭礼过後谣言也没平息，田中在年发生的张作霖炸死事件受到昭和天皇的斥责而被迫下台，次年随即病死。因此在当时的传言里面也说到田中也是将门怨灵作祟的受害者之一。
这个世界也发生过第二次世界大战，二战结束时，这个世界的日本同样是战败国。
随著停战条约使得日本成为美军的托管地。当时进驻日本的美军在重新整理因轰炸而成废墟的东京市时，美军的东京指挥总部恰好就设在将门首冢附近，当时的大藏省官厅已经成为一片废墟。
当时美军相中了这片废墟要清理出来作为美军总部的停车场。当时正在进行清理作业的工程人员清理到了将门首冢前的时候，操作推土机与挖掘机的工人突然暴毙，接著负责这个工程的美军参事官也突然死在两公里外的住所，接任这项工程的美军陆军工兵中尉也在接任的第二日发生车祸而死。
接二连三的连停车场工程的设计者也意外坠楼，使得当时的老东京人又想起了过去的传说而将将门怨灵作祟的故事又再度的流传出来。这件事情甚至惊动到了美军高层，在非正式的会议中决定了废除兴建停车场的计划，改让民间人士收购此处的土地。
当时的东京某民间团体以便宜的价格购入此地後，即著手重修将门首冢并且重新举行慰灵祭。昭和後期日本文部省文化财产保护局特别拨款补助再次重新修复将门首冢直到现在。
之后，平将门的怨灵倒是渐渐被安抚下来，其实，这还得从高天原说起了。
因为平将门在生前就是受到过高天原的册封的，所以说在平将门死后因为他本身就是妖怪的后代，所以比起普通的亡灵来说要强得多。
而且因为受到过高天原的册封，所以平将门死后也是进入不了黄泉之国的，毕竟高天原是伊邪纳岐的女儿天照所管理的。
而因为伊邪纳岐曾经在黄泉之国得罪了他的妹妹兼妻子伊邪那美，甚至是可以说是反目成仇的程度了。
所以打着高天原印记的平将门的亡灵是不会收到伊邪那美管理的黄泉之国的招待的。
怨灵之所以为怨灵，用日本的说法就是死后是不能成佛的亡灵。
而且那个时候，禅道在日本的发展并不是很好，可以说佛家的神明也还没有在日本站稳脚跟。
毕竟，佛家的发源地是在天竺，所以对于当时的佛家来说，平将门的亡灵是被高天原打过标记的，而佛家暂时也还不能够跟高天原叫板。
就这样，平将门的亡灵一直徘徊游荡，一直到管原道真被正式册封为学神的